Представительство РГАТА в Ярославле было открыто в 1999 году на базе департамента регулирования хозяйственной деятельности администрации области, и вот первый набор студентов успешно завершил заочное обучение. Выпускникам торжественно вручены 13 дипломов о втором высшем образовании. Два года и три месяца преподаватели РГАТА читали лекции, проводили лабораторные занятия, консультировали, принимали экзамены у студентов, которые учились по направлениям различных организаций и фирм.
Академия за пределами Рыбинска открыла уже два представительства - в Ярославле и Пошехонье и два филиала - в Тутаеве и Гаврилов-Яме.