Музей был основан по инициативе местных художников и любителей старины в 1919 году постановлением губернского отдела народного образования. Первая выставка была развёрнута на ткацкой фабрике «Красный Перекоп». Сегодня Ярославский художественный проводит ежегодно около пятидесяти выставок в России и за рубежом. Показать есть что: богатейшая коллекция насчитывает свыше 70 тысяч единиц хранения – это и собрание иконописи, и провинциальный портрет, ставший визитной карточкой музея, и произведения парижского периода творчества Константина Коровина, и эталонные полотна мастеров русского авангарда.
Более тридцати лет в музейных залах проходят музыкальные салоны с участием камерного ансамбля «Барокко». Начиная с 1996 года, здесь ежегодно проводятся научные чтения по проблемам изучения древнерусского искусства, работают театр-студия «Странник» и «Лаборатория перформанса».