Основное внимание уделялось оперативно-розыскной деятельности и выявлению преступлений. Таможенники препятствовали незаконному ввозу на территорию Ярославской области транспортных средств из стран ближнего и дальнего зарубежья. По сообщению пресс-службы ярославской таможни, за шесть месяцев 2004 года было выявлено семь фактов эксплуатации транспортных средств с нарушениями таможенных правил, задержано шесть автомашин, на одну органами следствия наложен арест.
На основании собранных отделом материалов было возбуждено шесть уголовных дел по фактам контрабанды и уклонения от уплаты таможенных платежей. Совместно с УБЭП УВД было проведено шесть проверок организаций, возбуждено два уголовных дела в отношении предпринимателей, занимавшихся реализацией контрафактной продукции.
Сотрудники оперативно-розыскного отдела также выявили организованную преступную группу, занимавшуюся незаконным оборотом наркотиков. Наркоторговцы, по оперативным данным, имеют отношение к контрабанде героина из Узбекистана. Шесть контрабандистов задержаны, из незаконного оборота изъято 500 граммов героина и четыре единицы газового оружия.