Хачилаев был арестован в связи с расследованием теракта против военнослужащих Внутренних войск, совершенного в центре Махачкалы 18 января. При обыске в его доме сотрудниками МВД были обнаружены винчестер, пистолет Стечкина с патронами и самодельное взрывное устройство. Прокуратура возбудила уголовное дело по статье 222 УК: «Незаконные приобретение, передача, сбыт, хранение, перевозка или ношение оружия, боеприпасов, взрывчатых веществ и взрывных устройств». В знак протеста Хачилаев, утверждавший, что пистолет и взрывное устройство были подброшены ему сотрудниками милиции и называвший процесс политическим, объявил голодовку. За неделю до суда он был переведен из следственного изолятора в больницу исправительной колонии в поселке Шамхал близ Махачкалы. Судьи руководствовались тем, что обыск в доме Хачилаева был проведен с грубыми нарушениями действующего законодательства. Председатель Союза мусульман России был полностью оправдан.
