Одним из первых Анатолия Лисицына поздравил Президент России Владимир Путин. В телеграмме главы государства говорится: «Уважаемый Анатолий Иванович! Поздравляю вас с официальным вступлением в должность губернатора Ярославской области. Вам предстоит продолжить работу по реализации перспективных планов и начинаний на благо региона и его жителей. Уверен, что в этом ответственном деле будут в полной мере востребованы присущие Вам высокие деловые качества, богатый опыт и авторитет. Желаю успехов. Доброго здоровья и всего наилучшего. В. Путин».
Председатель Совета Федерации Сергей Миронов поздравил Анатолия Лисицына «с высоким доверием Президента Российской Федерации и убедительной поддержкой депутатами Государственной думы области» и высказал уверенность, что эти решения свидетельствуют о высоком авторитете ярославского губернатора, «способного успешно решать непростые проблемы экономического и социального развития региона».
Анатолия Лисицына также поздравили председатель Правительства России Михаил Фрадков, заместитель руководителя администрации Президента РФ Владислав Сурков, многие депутаты Государственной Думы и члены Совета Федерации, руководители федеральных министерств и ведомств.